Ліпопротеїди в крові здійснюють транспорт ліпідів, в тому числі холестеролу, від однієї клітинної популяції до іншої. На відміну від інших ліпопротеїдів, ЛПВЩ здійснюють транспорт холестерину від клітин периферичних органів (у тому числі судин серця, артерій мозку та інші.) в печінку, де холестерол переводиться в жовчні кислоти і виводиться з організму. У жінок у середньому значення ЛПВЩ вище, ніж у чоловіків. Зниження концентрації ЛПВЩ холестерину, а також співвідношення холестерину ліпопротеїдів низької щільності до ліпопротеїдів високої щільності більше 3:1 пов'язується з підвищеним ризиком атеросклерозу. Підвищений рівень ЛПВЩ-холестеролу розглядається як антиатерогенний фактор. Ліпопротеїди низької щільності (ЛПНЩ) є основною транспортною формою холестеролу, переносячи його головним чином у вигляді ефірів холестеролу, від однієї клітинної популяції до іншої. Вважається, що показник холестерол-ЛПНЩ більше корелює з ризиком атеросклерозу, ніж рівень загального холестерину, оскільки саме ця фракція забезпечує приплив холестерину до судин і органів. В умовах патології ЛПНЩ захоплюються клітинами в стінках судин з утворенням атеросклеротичних бляшок, які звужують просвіт судин і сприяють тромбоутворенню. Підвищений рівень ЛПНЩ-холестерину можна розцінювати як високий ступінь ризику розвитку атеросклерозу та ішемічної хвороби серця.