Патологоанатомічне відділення є структурним підрозділом ДУ «ГМКЦ МВС України» і призначене для прижиттєвої діагностики захворювань та визначення причин і механізму смерті померлих.

Патологоанатомічне відділення має в своєму розпорядженні окреме приміщення прозекторської, яке розташовано на території установи і де відбувається прийом, розтин, зберігання, та видача тіл померлих родичам, а також патогістологічну лабораторію, яка розташована на 9 поверсі адміністративного корпусу установи і де проводиться гістологічне дослідження секційного, операційного та біопсійного матеріалу з метою встановлення діагнозу, розпізнання різних за формою і походженням запальних, гіперпластичних та пухлинних процесів, оцінки динаміки патологічного процесу, радикальності оперативного втручання, ефективності лікування. Відділення  забезпечене сучасним медичним обладнанням, апаратурою, інструментарієм та матеріалами необхідними для якісного і швидкого проведення досліджень, і в своїй роботі може, при необхідності, використовувати діагностично-допоміжні підрозділи установи.

Відділення очолює завідувач - лікар -патологоанатом вищої категорії.

У складі відділення працюють 2 лікаря-патологоанатома різних кваліфікаційних категорій, які застосовують на практиці досвід, отриманий під час підвищення кваліфікації на циклах тематичних удосконалень; висококваліфіковані фельшери-лаборанти, лаборанти, молодший медичний персонал.